持完成国家社科基金项目5项，其中国家社科基金重大项目2项（多学科视角下的南岛语族的起源与形成，2020-2025；中华南方民族的起源及形成，2005-2010）、国家社科基金重点项目1项（台湾原住民问题研究，2011-2016）、国家社科基金一般项目2项（汉藏语系谱系分类及其时间深度的研究，2010-2013；汉语方言与语言接触理论的研究，1999-2003）。主持完成教育部项目4项、中国科协重点项目1项、福建省社科基金重大项目1项。

代表性成果有《语言、族群与演化：语言人类学的传统与超越》（商务印书馆2019年版）、《中国的语言及方言的分类》（中华书局2009年版，入选2022年度国家社科基金中华学术外译项目推荐书目、福建省政府社科优秀成果奖）、《人类文化语言学》（厦门大学出版社1993年版）等。

    在Journal of Chinese Linguistics、Annals of human biology、American Journal of Physical Anthropology等SSCI、SCI期刊上发表学术论文10余篇，在《中国语文》《古汉语研究》《民族语文》等刊物发表学术论文60余篇，其中多篇被人大复印资料、高校文科学术文摘、中国社会科学报全文转载。论文《壮侗语族语言的数理分类及其时间深度》获教育部高等学校科学研究优秀成果奖、《藏缅语族语言的数理分类及其分析》获国家民委优秀社会科学成果奖、《中国数字科技馆—客家土楼》获联合国科教文组织2007世界信息峰会大奖、多篇论文获福建省政府优秀社科成果奖（其中二等奖2项，三等奖3项）等。